Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Cd1d1-202ENSMUST00000063869 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Edil3-203ENSMUST00000118731 2721 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Col1a2-201ENSMUST00000031668 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Ighv5-13-201ENSMUST00000193550 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cyp4f39Q8BGU0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Mir6392-201ENSMUST00000184924 108 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fermt2-201ENSMUST00000045905 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Vps29-204ENSMUST00000118830 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 1700022A21Rik-201ENSMUST00000182745 1051 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ip6k2-210ENSMUST00000194875 748 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Fgfr1-202ENSMUST00000117179 4046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cyp4f39Q8BGU0 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.9 ms