Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE7

Trim6, Tripartite motif-containing protein 6, mousemouse

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Length 488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim6Q8BGE7 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm16046-203ENSMUST00000150889 1001 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm6471-201ENSMUST00000097935 805 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Lrriq4-201ENSMUST00000108265 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 C1qtnf1-202ENSMUST00000106286 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 C1qtnf1-201ENSMUST00000017590 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Bak1-202ENSMUST00000078691 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Tmprss9-203ENSMUST00000219817 3581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Ciz1-202ENSMUST00000113331 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Trim6Q8BGE7 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Rfx1-204ENSMUST00000211046 3677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Mmab-202ENSMUST00000112245 644 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Gm28819-201ENSMUST00000186691 572 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Gm28840-208ENSMUST00000191514 738 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Abcd1-201ENSMUST00000002084 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Gm9920-204ENSMUST00000148544 2752 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Astl-204ENSMUST00000179618 2236 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Rsbn1-201ENSMUST00000051139 4762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Olfr667-202ENSMUST00000217177 2695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Trim6Q8BGE7 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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