Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGC0

Htatsf1, HIV Tat-specific factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htatsf1Q8BGC0 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Duxf3-202ENSMUST00000176875 2025 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm853-201ENSMUST00000023884 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Exoc6b-203ENSMUST00000160197 5439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Cops7b-202ENSMUST00000121534 5383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Rbmx-203ENSMUST00000114730 2019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm5566-201ENSMUST00000116118 459 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Caskin2-201ENSMUST00000041684 4929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Htatsf1Q8BGC0 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms