Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Gm42627-201ENSMUST00000197347 224 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Gm18935-201ENSMUST00000212692 664 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Cts7-204ENSMUST00000225321 1257 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Ccl24-201ENSMUST00000004936 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Tmem39bQ810L4 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Drd5-201ENSMUST00000041646 3152 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Lims2-201ENSMUST00000025254 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Gm6334-201ENSMUST00000207083 228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Tmem40-201ENSMUST00000072933 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Gal3st4-203ENSMUST00000161647 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tmem39bQ810L4 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms