Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU4

Smim19, Small integral membrane protein 19, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim19Q80ZU4 Rab10os-202ENSMUST00000177896 2872 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Wiz-201ENSMUST00000064694 2871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Asb10-202ENSMUST00000117900 1432 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
Smim19Q80ZU4 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Lmntd2-201ENSMUST00000026573 2095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rnf224-201ENSMUST00000091318 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Abi1-201ENSMUST00000078977 3027 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Vipr1-201ENSMUST00000035115 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Clec18a-203ENSMUST00000188466 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Clec18a-201ENSMUST00000039597 1998 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.83□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Hpse2-201ENSMUST00000099428 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rpn2-202ENSMUST00000116380 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Snx13-201ENSMUST00000048519 6231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Zfp853-202ENSMUST00000212355 2871 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gpsm2-201ENSMUST00000029482 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm11535-201ENSMUST00000145517 778 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Vps4b-201ENSMUST00000094646 4633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Smim19Q80ZU4 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms