Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Gm30214-201ENSMUST00000199271 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Pdcd6-203ENSMUST00000222759 1376 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Toe1-202ENSMUST00000106455 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Canx-201ENSMUST00000020637 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Akp-ps1-201ENSMUST00000188050 1600 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Sox2ot-205ENSMUST00000196795 754 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Rpl7a-ps10-201ENSMUST00000190579 798 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Rn7sk-201ENSMUST00000083103 331 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm26315-201ENSMUST00000083890 321 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Gm24447-201ENSMUST00000083977 338 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Rpl7a-ps3-201ENSMUST00000090170 796 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Rpl7a-ps5-201ENSMUST00000095218 807 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Atg2bQ80XK6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.1 ms