Protein–RNA interactions for Protein: Q80U56

Avl9, Late secretory pathway protein AVL9 homolog, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Avl9Q80U56 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Ube4bos1-202ENSMUST00000151896 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Tspan32-206ENSMUST00000105925 1376 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Aip-202ENSMUST00000117831 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Knop1-203ENSMUST00000106549 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Ablim1-202ENSMUST00000099294 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm12416-201ENSMUST00000120911 1008 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm15821-201ENSMUST00000121995 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm26464-201ENSMUST00000157094 305 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 1700067P10Rik-201ENSMUST00000022028 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm7446-201ENSMUST00000221035 1240 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
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Avl9Q80U56 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Car6-202ENSMUST00000105683 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm7324-201ENSMUST00000094051 1647 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Zkscan14-203ENSMUST00000198959 2243 ntBASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Avl9Q80U56 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
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