Protein–RNA interactions for Protein: Q80U30

Clec16a, Protein CLEC16A, mousemouse

Predictions only

Length 1,036 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec16aQ80U30 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Agrp-202ENSMUST00000194091 734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Lnx1-205ENSMUST00000117525 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Paqr8-202ENSMUST00000167119 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Spef1-202ENSMUST00000110218 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Sqle-201ENSMUST00000022977 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm9924-202ENSMUST00000192760 2311 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Metap2-206ENSMUST00000180840 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm37795-201ENSMUST00000194216 2459 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Slc22a2-201ENSMUST00000046959 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Pias3-202ENSMUST00000107076 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Grin1-203ENSMUST00000114308 4165 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Clec16aQ80U30 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms