Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Gm18529-201ENSMUST00000193025 1257 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Gm18150-201ENSMUST00000195341 645 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Gm43136-201ENSMUST00000200403 636 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Gm8952-201ENSMUST00000206828 1102 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 AC170810.2-201ENSMUST00000228384 1232 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Ssxb2-201ENSMUST00000023931 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Cxcl2-201ENSMUST00000075433 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Col3a1-201ENSMUST00000087883 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 9130604C24Rik-201ENSMUST00000197965 956 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 AC166830.1-201ENSMUST00000224201 533 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Olfr791-201ENSMUST00000057477 939 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Gm21994-201ENSMUST00000063463 990 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Nutf2-ps1-201ENSMUST00000095978 864 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Ift52-201ENSMUST00000018002 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Gm37960-201ENSMUST00000192402 1897 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SnphQ80U23 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Gm18881-201ENSMUST00000220450 1545 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 AC154186.1-201ENSMUST00000227711 1597 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Gm11896-201ENSMUST00000121105 820 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Gm13184-201ENSMUST00000149932 626 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Gm28694-201ENSMUST00000190681 722 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Gm29416-202ENSMUST00000191328 1201 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Gm37458-201ENSMUST00000194055 410 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 AC154765.1-201ENSMUST00000217732 439 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Cdkn3-201ENSMUST00000067426 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Olfr154-201ENSMUST00000099918 1079 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SnphQ80U23 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms