Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSF0

Dsg1c, Desmoglein-1-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg1cQ7TSF0 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Hnrnpm-202ENSMUST00000114385 2550 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Hif3a-202ENSMUST00000108492 6402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Rpl36al-203ENSMUST00000110620 757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Kdm4b-201ENSMUST00000025036 4577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gpat2-201ENSMUST00000062211 2628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Sim2-201ENSMUST00000072182 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Hmx2-201ENSMUST00000051997 3102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Atp2a3-203ENSMUST00000108485 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 R3hcc1-206ENSMUST00000216152 1467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cog7-201ENSMUST00000057576 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ppp1r12b-201ENSMUST00000045665 8840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Dsg1cQ7TSF0 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms