Protein–RNA interactions for Protein: Q7M729

Scn4b, Sodium channel subunit beta-4, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4bQ7M729 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Scn4bQ7M729 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Erg-206ENSMUST00000122199 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Scn4bQ7M729 Pfkfb3-212ENSMUST00000170196 2163 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Scn4bQ7M729 Matn3-201ENSMUST00000020899 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Lpar2-202ENSMUST00000164890 5800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Fam57b-202ENSMUST00000098032 1894 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Cpeb4-201ENSMUST00000020543 2312 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Scn4bQ7M729 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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