Protein–RNA interactions for Protein: Q78RX3

Smim12, Small integral membrane protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim12Q78RX3 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Spib-201ENSMUST00000035323 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Bcat1-202ENSMUST00000048252 1642 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 2310007B03Rik-202ENSMUST00000143419 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 L1td1-204ENSMUST00000173659 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gngt2-201ENSMUST00000036088 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Cln3-203ENSMUST00000098036 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Cacna1g-205ENSMUST00000107786 7984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Cacna1g-210ENSMUST00000107792 7981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Arhgef2-208ENSMUST00000175911 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gucy1a2-201ENSMUST00000115733 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Pigq-209ENSMUST00000140304 1835 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Npc1-201ENSMUST00000025279 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Slc11a2-201ENSMUST00000023774 3025 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm16251-201ENSMUST00000162649 338 ntTSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm18934-201ENSMUST00000216671 1044 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Aspdh-201ENSMUST00000035929 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Asph-202ENSMUST00000078139 6694 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC11.56□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Ap3s1-201ENSMUST00000025357 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Ap5z1-202ENSMUST00000196055 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
Smim12Q78RX3 Slc6a21-206ENSMUST00000210861 2838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms