Protein–RNA interactions for Protein: Q78HU7

Gypc, Glycophorin-C, mousemouse

Predictions only

Length 95 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GypcQ78HU7 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Gm13387-202ENSMUST00000131147 2646 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Gars-201ENSMUST00000003572 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
GypcQ78HU7 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms