Protein–RNA interactions for Protein: Q76I25

Higd1c, HIG1 domain family member 1C, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd1cQ76I25 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Agrn-201ENSMUST00000071248 4831 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
Higd1cQ76I25 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Sgce-203ENSMUST00000101677 1656 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 D6Ertd527e-204ENSMUST00000204927 2218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Mtus2-203ENSMUST00000085558 7543 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Nr4a2-203ENSMUST00000112629 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Crhr2-201ENSMUST00000003568 2695 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ecm1-202ENSMUST00000117507 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm43703-201ENSMUST00000200523 763 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Tmprss9-201ENSMUST00000105333 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ano1-201ENSMUST00000033393 4585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 AC159196.2-201ENSMUST00000224082 1622 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Higd1cQ76I25 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.7 ms