Protein–RNA interactions for Protein: Q704Y3

Trpv1, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 1, mousemouse

Predictions only

Length 839 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv1Q704Y3 Hck-204ENSMUST00000191431 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Zdhhc12-201ENSMUST00000081838 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Cyp1a2-201ENSMUST00000034860 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Rps19-203ENSMUST00000108430 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Pqbp1-203ENSMUST00000115655 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Crb3-205ENSMUST00000169543 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Gnpda2-207ENSMUST00000173927 1011 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 S100a8-201ENSMUST00000069927 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Cngb1-201ENSMUST00000093268 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trpv1Q704Y3 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Eno2-216ENSMUST00000204896 1640 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Acsl6-201ENSMUST00000000145 2297 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Ak6-205ENSMUST00000190729 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm37388-201ENSMUST00000193984 429 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Acyp1-202ENSMUST00000065913 448 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Olfr156-202ENSMUST00000079465 1099 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Oas1f-201ENSMUST00000057814 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Slc25a22-202ENSMUST00000106006 2277 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Prss42-201ENSMUST00000035715 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trpv1Q704Y3 Sdccag8-202ENSMUST00000056773 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms