Protein–RNA interactions for Protein: Q6XAS4

Ssxb3, SSXB3 protein, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb3Q6XAS4 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb3Q6XAS4 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb3Q6XAS4 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb3Q6XAS4 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb3Q6XAS4 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb3Q6XAS4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb3Q6XAS4 Krt26-201ENSMUST00000100482 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb3Q6XAS4 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb3Q6XAS4 Nfyb-204ENSMUST00000130911 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ssxb3Q6XAS4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gm26525-201ENSMUST00000180666 3616 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Xrra1-201ENSMUST00000036155 2731 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Clstn2-202ENSMUST00000162295 4174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Usf1-208ENSMUST00000161241 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Higd1a-205ENSMUST00000215007 1980 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Zmynd15-202ENSMUST00000092958 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Arfgap1-205ENSMUST00000108862 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 9030612E09Rik-201ENSMUST00000053792 1859 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Lamtor2-202ENSMUST00000119002 568 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Ssxb3Q6XAS4 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
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