Protein–RNA interactions for Protein: Q6UQ17

Atp8b3, Phospholipid-transporting ATPase IK, mousemouse

Predictions only

Length 1,335 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b3Q6UQ17 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Atp8b3Q6UQ17 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Aym1-201ENSMUST00000066573 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Atp8b3Q6UQ17 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Kcnk13-202ENSMUST00000160413 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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Atp8b3Q6UQ17 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Atp8b3Q6UQ17 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Atp8b3Q6UQ17 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Atp8b3Q6UQ17 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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Atp8b3Q6UQ17 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Grk4-201ENSMUST00000001112 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Atp8b3Q6UQ17 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Zmat5-201ENSMUST00000009220 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Pigg-202ENSMUST00000118910 3030 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Atp8b3Q6UQ17 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms