Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD21

Shb, SH2 domain-containing adapter protein B, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShbQ6PD21 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm16555-201ENSMUST00000159971 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm12624-201ENSMUST00000177615 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm12621-201ENSMUST00000177760 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm12615-201ENSMUST00000177970 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm12622-201ENSMUST00000177975 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm12625-201ENSMUST00000179122 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm9004-201ENSMUST00000218739 1222 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Olfr1423-201ENSMUST00000087831 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Fetub-203ENSMUST00000167399 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm17208-201ENSMUST00000168388 535 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm13381-202ENSMUST00000177012 640 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Nppc-201ENSMUST00000027449 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Iqcf6-201ENSMUST00000171091 537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Ccser2-208ENSMUST00000183007 1293 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Acta1-201ENSMUST00000034453 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Mogat2-201ENSMUST00000064231 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 4833439L19Rik-201ENSMUST00000026989 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
ShbQ6PD21 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms