Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFX3

Krt40, Keratin, type I cytoskeletal 40, mousemouse

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Length 439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt40Q6IFX3 Mir1982-201ENSMUST00000157368 74 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm16136-203ENSMUST00000162520 1121 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 C330013E15Rik-201ENSMUST00000181034 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm29649-201ENSMUST00000185649 419 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 1700123K08Rik-201ENSMUST00000031501 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Cpped1-203ENSMUST00000121750 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm13716-201ENSMUST00000126401 808 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Atpif1-203ENSMUST00000152993 462 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Proscos-202ENSMUST00000178990 666 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Ceacam10-201ENSMUST00000038069 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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Krt40Q6IFX3 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Gm10244-201ENSMUST00000090237 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Krt40Q6IFX3 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Cpsf4l-203ENSMUST00000106617 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 G6pc3-201ENSMUST00000070334 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Krt40Q6IFX3 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
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