Protein–RNA interactions for Protein: Q6DID3

Scaf8, Protein SCAF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf8Q6DID3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Tex19.1-201ENSMUST00000039088 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Fgl1-201ENSMUST00000034003 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Lsm7-201ENSMUST00000035775 468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm25668-201ENSMUST00000157700 129 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Dlgap4-201ENSMUST00000000094 1411 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm9755-201ENSMUST00000032981 1356 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Hsd3b4-202ENSMUST00000196861 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm10681-201ENSMUST00000058728 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Calca-204ENSMUST00000205714 416 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm44985-201ENSMUST00000206202 1016 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Taldo1-201ENSMUST00000026576 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Lrp2bp-202ENSMUST00000110380 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Prss8-202ENSMUST00000206124 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Cep97-206ENSMUST00000122280 1057 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Pced1c-ps-201ENSMUST00000187740 751 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Scaf8Q6DID3 Gsdmcl-ps-204ENSMUST00000191285 637 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms