Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Sirt3-210ENSMUST00000211179 1606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Litaf-201ENSMUST00000023143 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Tcf3-205ENSMUST00000105341 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Tmem129-204ENSMUST00000200849 657 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Cttnbp2nl-202ENSMUST00000098763 4834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm10729-202ENSMUST00000193403 1375 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gstcd-202ENSMUST00000080583 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Eml3-201ENSMUST00000096241 3322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Spata5-209ENSMUST00000198968 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Pkp4Q68FH0 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Dhx57-201ENSMUST00000038166 4918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Pkp4Q68FH0 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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