Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG3

Spty2d1, Protein SPT2 homolog, mousemouse

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spty2d1Q68FG3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Txnrd3-201ENSMUST00000000828 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Spty2d1Q68FG3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Bnc2-215ENSMUST00000176691 3385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Usp16-202ENSMUST00000119504 2562 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm14455-201ENSMUST00000138288 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Slc25a46-201ENSMUST00000060396 4371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Zfp354c-201ENSMUST00000000632 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Mcm9-206ENSMUST00000220007 3513 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Adamts20-204ENSMUST00000155907 6886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Spty2d1Q68FG3 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms