Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Clcf1-201ENSMUST00000046506 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 AC153366.2-201ENSMUST00000219461 1984 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm16479-201ENSMUST00000121706 932 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm12945-201ENSMUST00000140080 674 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Ly6g5b-202ENSMUST00000172854 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 AC155637.1-201ENSMUST00000218560 636 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Tescl-201ENSMUST00000069562 855 ntAPPRIS P1 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Tdrd5-201ENSMUST00000121146 3759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Avpr2-201ENSMUST00000033765 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gabarapl1-204ENSMUST00000204956 539 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Mettl5-201ENSMUST00000060447 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Chchd1-201ENSMUST00000071215 616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Cryge-201ENSMUST00000087359 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm14608-201ENSMUST00000120030 1553 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 4930524O07Rik-201ENSMUST00000161822 1050 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Duoxa2-201ENSMUST00000028656 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Lats2-202ENSMUST00000038381 933 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Krt17-201ENSMUST00000080893 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Synj2bp-205ENSMUST00000169158 691 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm38144-201ENSMUST00000192790 465 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 CT573034.1-201ENSMUST00000222983 313 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Kiaa1549Q68FD9 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms