Protein–RNA interactions for Protein: Q64287

Irf4, Interferon regulatory factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf4Q64287 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Prss55-203ENSMUST00000171503 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 4930438A08Rik-202ENSMUST00000208022 918 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Pltp-203ENSMUST00000109317 1575 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Trpc7-206ENSMUST00000173513 2241 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Tnfrsf19-205ENSMUST00000225730 744 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Olfr222-201ENSMUST00000071943 1115 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Irf4Q64287 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Car3-201ENSMUST00000029076 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 1700029H14Rik-205ENSMUST00000187391 1408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Il1r1-202ENSMUST00000114795 4832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Irf4Q64287 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms