Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Hnrnpa3-207ENSMUST00000164947 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm6254-201ENSMUST00000168178 1072 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm9242-201ENSMUST00000177820 1074 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm7467-201ENSMUST00000185173 652 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm8913-201ENSMUST00000209491 641 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Ccdc28a-202ENSMUST00000080860 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Ace3-201ENSMUST00000190995 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Tmed9-203ENSMUST00000224741 1450 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 H3f3b-202ENSMUST00000106454 2514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Prpf3-201ENSMUST00000015892 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Rad54b-202ENSMUST00000095145 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm11596-201ENSMUST00000105058 1079 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm11961-202ENSMUST00000141157 760 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 C230062I16Rik-204ENSMUST00000208342 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 AC131330.1-201ENSMUST00000227814 1015 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Tspan8-201ENSMUST00000035563 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 CU062626.3-201ENSMUST00000225522 1411 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm8566-201ENSMUST00000120174 465 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Plekha4-201ENSMUST00000051810 2660 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 4930423D22Rik-201ENSMUST00000221909 1674 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Zyx-201ENSMUST00000070635 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Tars2-202ENSMUST00000074339 2313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Nde1-203ENSMUST00000117958 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm14291-201ENSMUST00000143645 804 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm23699-201ENSMUST00000158835 135 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm3096-201ENSMUST00000185770 364 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Arl6ip6-201ENSMUST00000028336 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Tnfrsf18-202ENSMUST00000103173 1189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 2310047D07Rik-201ENSMUST00000189493 735 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Mrps21-201ENSMUST00000067298 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Col4a5Q63ZW6 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms