Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Dsp-202ENSMUST00000127906 7761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Mir698-201ENSMUST00000102164 109 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Scg3-201ENSMUST00000034699 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Scin-202ENSMUST00000078481 2654 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Abat-203ENSMUST00000115839 2414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gm20479-201ENSMUST00000126587 556 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Tspyl5-201ENSMUST00000042021 4010 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Zfp202-201ENSMUST00000026693 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Uqcrq-201ENSMUST00000061326 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Samd11-202ENSMUST00000217934 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Fbxw9-201ENSMUST00000095220 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Sin3bQ62141 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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