Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 Arhgap33-203ENSMUST00000207858 4337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Bend7-201ENSMUST00000056914 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 2310022A10Rik-204ENSMUST00000187032 1871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Rpl21-201ENSMUST00000035983 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Brinp1-201ENSMUST00000030036 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Gm6871-201ENSMUST00000073410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Cnbd2-202ENSMUST00000073942 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Ephx2-201ENSMUST00000070515 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Ddb2-201ENSMUST00000028696 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Pla2g4c-204ENSMUST00000167232 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Traf1-202ENSMUST00000113064 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Acat2-201ENSMUST00000007005 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Kars-203ENSMUST00000164470 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Ginm1-204ENSMUST00000124838 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Spin1-201ENSMUST00000095797 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Camta2-203ENSMUST00000108544 4632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Zbtb39-201ENSMUST00000054287 5960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Tmem51os1-204ENSMUST00000153023 3440 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Abcd2Q61285 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
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