Protein–RNA interactions for Protein: Q61124

Cln3, Battenin, mousemouse

Predictions only

Length 438 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln3Q61124 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Hbb-bs-201ENSMUST00000023934 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Exosc7-201ENSMUST00000026891 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm45338-207ENSMUST00000211499 1405 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Rtraf-201ENSMUST00000022341 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Bscl2-206ENSMUST00000160556 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm15917-201ENSMUST00000162771 487 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Atp6ap1-201ENSMUST00000019231 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Ap1s2-202ENSMUST00000069041 2226 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 0610037L13Rik-205ENSMUST00000119394 741 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm11793-201ENSMUST00000120433 981 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm21156-201ENSMUST00000189693 869 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Crip2-206ENSMUST00000200380 864 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Abhd6-203ENSMUST00000225234 1958 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 4930433J02Rik-201ENSMUST00000194719 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 E130006D01Rik-203ENSMUST00000137398 906 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cln3Q61124 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms