Protein–RNA interactions for Protein: Q61087

Lamb3, Laminin subunit beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamb3Q61087 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamb3Q61087 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Slc6a19os-201ENSMUST00000022049 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gm13288-201ENSMUST00000094977 2850 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gpr132-201ENSMUST00000021729 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gm16122-201ENSMUST00000142625 1158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Anapc11-201ENSMUST00000026128 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Galnt6-202ENSMUST00000159715 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Igf2r-201ENSMUST00000024599 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Fcgr1-201ENSMUST00000029748 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Has3-203ENSMUST00000176144 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Cnih4-204ENSMUST00000134115 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Calcr-203ENSMUST00000168592 2064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Slc6a8-201ENSMUST00000033752 3964 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Arhgap33-207ENSMUST00000208538 4372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Lamb3Q61087 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamb3Q61087 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamb3Q61087 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamb3Q61087 Per2-201ENSMUST00000069620 5833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamb3Q61087 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamb3Q61087 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamb3Q61087 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamb3Q61087 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamb3Q61087 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamb3Q61087 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamb3Q61087 Ulk3-201ENSMUST00000053230 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Lamb3Q61087 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms