Protein–RNA interactions for Protein: Q60980

Klf3, Krueppel-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf3Q60980 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Pde12-201ENSMUST00000052932 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Hdac7-202ENSMUST00000088402 4223 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Olfr322-204ENSMUST00000214392 4779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Slc35b1-201ENSMUST00000021243 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Pitpnm2-205ENSMUST00000161273 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Mettl11b-201ENSMUST00000159679 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Tmem219-202ENSMUST00000119781 1118 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm24420-201ENSMUST00000176676 59 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 4930502C17Rik-201ENSMUST00000200282 948 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Reep5-201ENSMUST00000006027 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Per1-206ENSMUST00000166748 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Klf3Q60980 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.4 ms