Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Angptl7-201ENSMUST00000030840 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
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JrkQ60976 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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JrkQ60976 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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JrkQ60976 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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JrkQ60976 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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JrkQ60976 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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JrkQ60976 Dnpep-203ENSMUST00000185419 2833 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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JrkQ60976 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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JrkQ60976 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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JrkQ60976 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
JrkQ60976 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Vmn1r45-207ENSMUST00000228492 2849 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
JrkQ60976 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
JrkQ60976 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Mrps9-201ENSMUST00000057208 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gm45743-201ENSMUST00000212701 2795 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
JrkQ60976 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.4 ms