Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Adal-205ENSMUST00000119031 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Rassf5-201ENSMUST00000027688 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Spsb1-201ENSMUST00000038562 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 H2-Q6-202ENSMUST00000174699 2085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Slc6a4-202ENSMUST00000108402 2796 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Shf-202ENSMUST00000110530 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ighv1-51-201ENSMUST00000192903 354 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm42928-201ENSMUST00000197338 3339 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Slc12a8-202ENSMUST00000117134 2081 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Rbbp4Q60972 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Mmp2-201ENSMUST00000034187 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Adsl-206ENSMUST00000168756 1439 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Mtmr2-208ENSMUST00000155679 3088 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Men1-208ENSMUST00000113504 2663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rbbp4Q60972 Armcx6-202ENSMUST00000113194 2120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms