Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm11559-201ENSMUST00000092694 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Ccdc188-201ENSMUST00000167061 747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm13097-201ENSMUST00000210722 397 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm8959-201ENSMUST00000213150 571 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Atf3Q60765 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Rfx7-205ENSMUST00000184015 1554 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Cdk2ap1-204ENSMUST00000111474 1286 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Mogat1-202ENSMUST00000113524 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm7857-201ENSMUST00000117957 358 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Mir6927-201ENSMUST00000184494 71 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Mir7032-201ENSMUST00000185154 79 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm29264-201ENSMUST00000191240 1264 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm29856-201ENSMUST00000191905 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Prorsd1-201ENSMUST00000039900 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Cryga-201ENSMUST00000061497 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Plekhb1-203ENSMUST00000107044 1806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Cd27-201ENSMUST00000032486 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm8862-201ENSMUST00000198379 1346 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Cd300lf-202ENSMUST00000106561 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm14130-201ENSMUST00000118417 987 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm13316-201ENSMUST00000140537 691 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 4930594M17Rik-201ENSMUST00000181204 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Tmem176b-209ENSMUST00000204073 986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Lat2-205ENSMUST00000200998 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 0610006L08Rik-201ENSMUST00000205326 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atf3Q60765 Pla2g1b-202ENSMUST00000112071 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms