Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm44086-201ENSMUST00000203251 2349 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gpd2-201ENSMUST00000028167 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Hoxb13-201ENSMUST00000062709 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Sema7a-201ENSMUST00000043059 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm5939-201ENSMUST00000119613 2874 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ocrl-203ENSMUST00000115020 3210 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Arhgef37-201ENSMUST00000171629 3234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ripor3-201ENSMUST00000099073 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a14-201ENSMUST00000033431 1760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Cfp-201ENSMUST00000001156 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Faap100-201ENSMUST00000026448 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Atp9a-204ENSMUST00000109177 3456 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Usf1-207ENSMUST00000160486 1878 ntTSL 2 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Nr3c1-201ENSMUST00000025300 4989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Acsf3-203ENSMUST00000212790 2171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Trp53-203ENSMUST00000108658 1771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Trp53-201ENSMUST00000005371 1772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Rxrg-204ENSMUST00000111386 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Rsl1-201ENSMUST00000021997 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Shisa9-202ENSMUST00000170672 3421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Tnk1-203ENSMUST00000108628 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Nfkb2-202ENSMUST00000111881 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Teddm2-202ENSMUST00000123490 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ticrr-201ENSMUST00000035977 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq3-201ENSMUST00000070256 11824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Kcnc2-204ENSMUST00000219301 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Gm26616-202ENSMUST00000195676 3107 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Efhc1-201ENSMUST00000038447 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ttc5-201ENSMUST00000006451 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Eps15l1-203ENSMUST00000212121 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 G6pdx-201ENSMUST00000004327 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
Sft2d1Q5SSN7 Foxl2os-201ENSMUST00000181706 3095 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.9 ms