Protein–RNA interactions for Protein: Q4QQM4

Trp53i11, Tumor protein p53-inducible protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53i11Q4QQM4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 B3gat1-204ENSMUST00000160899 3801 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Dpysl5-202ENSMUST00000101442 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Fut7-202ENSMUST00000100320 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Zfpm2-201ENSMUST00000053467 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gm8337-201ENSMUST00000187358 1938 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Abhd14b-201ENSMUST00000048527 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 4930432H08Rik-201ENSMUST00000198220 1284 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Actn4-201ENSMUST00000068045 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Pcgf2-201ENSMUST00000018681 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Enc1-201ENSMUST00000041623 4737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Tlk2-209ENSMUST00000145048 2776 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gm15240-201ENSMUST00000118156 720 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Olfr283-201ENSMUST00000057386 1102 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trp53i11Q4QQM4 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms