Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Trmt112-ps1-201ENSMUST00000202320 375 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm11563-201ENSMUST00000092695 1012 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Agbl3-202ENSMUST00000115012 790 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Agbl3-203ENSMUST00000115014 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm34549-203ENSMUST00000208300 896 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gypc-202ENSMUST00000174000 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Ociad2-205ENSMUST00000201908 2378 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Cox16-206ENSMUST00000168463 431 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Ssr2-202ENSMUST00000192495 620 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm13016-201ENSMUST00000126252 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Aurka-203ENSMUST00000109140 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm11754-201ENSMUST00000156576 661 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Myl10-202ENSMUST00000196068 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Myl10-203ENSMUST00000196436 598 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc3lQ4KL14 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms