Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Spdye4b-202ENSMUST00000159781 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 2900093K20Rik-201ENSMUST00000190930 567 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm16315-201ENSMUST00000163009 783 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Txn2-201ENSMUST00000005487 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ddx49Q4FZF3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Ddx49Q4FZF3 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms