Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

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Length 975 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 AW209491-202ENSMUST00000178289 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm9063-201ENSMUST00000223299 582 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Trim27-206ENSMUST00000222544 4312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm14371-201ENSMUST00000138925 1518 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ate1-202ENSMUST00000035458 4685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Coq4-201ENSMUST00000028137 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Syne3Q4FZC9 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Syne3Q4FZC9 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Vwc2-202ENSMUST00000109681 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Fam19a2-201ENSMUST00000050756 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 E430024P14Rik-203ENSMUST00000160545 2833 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Capns2-201ENSMUST00000104947 1005 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Syne3Q4FZC9 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.4 ms