Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Traf6-201ENSMUST00000004949 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Rgma-201ENSMUST00000094312 3586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Clcnkb-201ENSMUST00000006378 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 B230369F24Rik-201ENSMUST00000141846 2560 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Plekhn1-203ENSMUST00000217885 1982 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Cdc25a-204ENSMUST00000198308 2880 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Ankrd61-203ENSMUST00000110718 1774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Pou2f1-209ENSMUST00000160908 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Zscan20-202ENSMUST00000097877 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Apopt1-203ENSMUST00000162316 3107 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Cad-201ENSMUST00000013773 7137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Yeats2-201ENSMUST00000090052 5997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Rtp3-201ENSMUST00000084922 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Ahdc1-203ENSMUST00000105915 6341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Rbm10-207ENSMUST00000177738 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Rbm10-201ENSMUST00000064911 2793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Dennd4c-202ENSMUST00000082026 7940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Dcaf4-208ENSMUST00000223291 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
H2al1nQ497L1 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms