Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Mrpl58-209ENSMUST00000153983 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm14730-201ENSMUST00000122378 1045 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm15948-201ENSMUST00000150616 403 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Mrpl30-205ENSMUST00000193673 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm5276-201ENSMUST00000196683 1047 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm7498-201ENSMUST00000203282 1084 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm11149-204ENSMUST00000216483 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Rnase2b-201ENSMUST00000075648 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Metap1d-201ENSMUST00000037210 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Trim27-201ENSMUST00000021761 4204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Serpine3-201ENSMUST00000171692 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Ppt2-209ENSMUST00000171121 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Rbbp8-201ENSMUST00000047322 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Lin28bQ45KJ6 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms