Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ39

Lrrfip1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrfip1Q3UZ39 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Pmvk-202ENSMUST00000107410 652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Rab1a-202ENSMUST00000109601 1200 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Scyl3-201ENSMUST00000027876 4368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Amdhd2-201ENSMUST00000040735 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem9-201ENSMUST00000063719 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Rgs9bp-201ENSMUST00000069912 6590 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Hcrt-202ENSMUST00000107360 509 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Yipf6-201ENSMUST00000054697 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Acox3-204ENSMUST00000114238 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ces2f-201ENSMUST00000076384 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Myh7-201ENSMUST00000102803 6135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm36979-201ENSMUST00000193616 539 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Chml-201ENSMUST00000104984 6905 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Chml-202ENSMUST00000209720 6905 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Slc41a3-201ENSMUST00000032177 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Gnb5-202ENSMUST00000213990 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Lrrfip1Q3UZ39 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms