Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Cmip-201ENSMUST00000095172 2276 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ell-201ENSMUST00000093454 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm18057-201ENSMUST00000208220 503 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 AC154595.3-201ENSMUST00000224579 384 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Dmbx1-201ENSMUST00000064806 5799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Zmiz1os1-201ENSMUST00000156682 3469 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Hk3-208ENSMUST00000153665 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Wdr70-201ENSMUST00000045766 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Mrvi1-201ENSMUST00000005751 6198 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Rbm46-201ENSMUST00000048647 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Jazf1-201ENSMUST00000074541 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Arcn1-201ENSMUST00000034607 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Kansl2-ps-201ENSMUST00000181818 1461 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Pfdn4Q3UWL8 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Sipa1-202ENSMUST00000080824 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Cep131-201ENSMUST00000106227 3578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Cep131-202ENSMUST00000106229 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Cep131-207ENSMUST00000180242 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Ak4-201ENSMUST00000102780 4186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Pfas-201ENSMUST00000021282 6373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Pfdn4Q3UWL8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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