Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW77

Gm12888, MCG59630, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm12888Q3UW77 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Il13ra1-201ENSMUST00000033418 3712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Zeb2-201ENSMUST00000028229 5335 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Glis3-209ENSMUST00000162022 7514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Dcaf11-204ENSMUST00000121622 2379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Jade1-204ENSMUST00000170711 2896 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Slc7a7-202ENSMUST00000195970 2057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Aff3-202ENSMUST00000039827 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Ubr7-201ENSMUST00000046404 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Slx4-201ENSMUST00000040790 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Nfatc2ip-201ENSMUST00000075671 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Sorcs1-203ENSMUST00000164039 7241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Stpg2-202ENSMUST00000106239 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Tmtc3-201ENSMUST00000058154 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Smg7-203ENSMUST00000111836 3928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Gm6756-201ENSMUST00000180647 1620 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Cacna1c-201ENSMUST00000075591 7584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Mbp-207ENSMUST00000114674 2108 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Top1mt-201ENSMUST00000000958 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Ackr4-204ENSMUST00000219146 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Eif2b2-201ENSMUST00000004910 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Ncaph-201ENSMUST00000110387 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Gm12888Q3UW77 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms