Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU56

Gm29609, Predicted gene 29609, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm29609Q3UU56 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm29609Q3UU56 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm29609Q3UU56 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm29609Q3UU56 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm29609Q3UU56 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm29609Q3UU56 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Gm29609Q3UU56 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Gm29609Q3UU56 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Gm29609Q3UU56 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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Gm29609Q3UU56 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Atp6v0c-201ENSMUST00000024932 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Ric8b-202ENSMUST00000095385 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Gm29609Q3UU56 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
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