Protein–RNA interactions for Protein: Q3UL53

Crxos, Cone-rod homeobox, opposite strand, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrxosQ3UL53 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Atp5j2-202ENSMUST00000161741 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Gm45668-201ENSMUST00000211271 493 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 E230029C05Rik-202ENSMUST00000207458 2445 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Llgl2-212ENSMUST00000177736 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Suv39h1-201ENSMUST00000115636 2707 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Acadm-201ENSMUST00000072697 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Smyd3-207ENSMUST00000194237 1047 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Cog3-201ENSMUST00000049168 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Timm9-206ENSMUST00000221367 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Zfp647-201ENSMUST00000048854 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
CrxosQ3UL53 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.7 ms