Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Prg4-207ENSMUST00000162367 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Tbx6-202ENSMUST00000172352 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gnai1-201ENSMUST00000074694 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Slc38a7-204ENSMUST00000212270 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Lca5-202ENSMUST00000034793 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Pla2g5-204ENSMUST00000102513 2289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Ptpn6-201ENSMUST00000004377 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Slc52a3-201ENSMUST00000073228 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Prdx2-203ENSMUST00000109734 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Dao-203ENSMUST00000161610 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Cenpl-202ENSMUST00000111618 1996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Trim45-203ENSMUST00000106980 3337 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Selenbp1-201ENSMUST00000090839 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Selenbp2-201ENSMUST00000090848 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Ighv2-3-201ENSMUST00000178229 347 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gm43134-201ENSMUST00000199434 1886 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Mpv17-201ENSMUST00000154241 1724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 AC139054.1-201ENSMUST00000226898 1598 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Lrrc8a-202ENSMUST00000113654 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gosr2-202ENSMUST00000107013 1044 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gm15420-201ENSMUST00000133274 382 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Smim17-203ENSMUST00000161855 664 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Fbxl12-207ENSMUST00000151861 1668 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Cdadc1-201ENSMUST00000022555 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Cd81-201ENSMUST00000037941 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Matr3-206ENSMUST00000187389 3107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Alox12e-201ENSMUST00000019051 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 1700012C14Rik-201ENSMUST00000132023 498 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Dpm3-201ENSMUST00000040824 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gm5129-201ENSMUST00000065372 300 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Alkbh4-201ENSMUST00000041100 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gpr19-208ENSMUST00000165392 1643 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Gpr19-202ENSMUST00000066107 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Usp19Q3UJD6 Umad1-204ENSMUST00000159433 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms