Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Slc44a4-201ENSMUST00000007249 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Acly-203ENSMUST00000107389 4426 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Ntm-203ENSMUST00000115237 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Prkar1b-202ENSMUST00000110889 2457 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm13814-201ENSMUST00000141341 3077 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Ttc25-202ENSMUST00000092684 2240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Pbld1-202ENSMUST00000178684 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Fibin-201ENSMUST00000099626 2267 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Alx1-201ENSMUST00000040859 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 4930432E11Rik-202ENSMUST00000063585 10871 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Pdlim3-201ENSMUST00000034053 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm16244-201ENSMUST00000159313 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Ap1g2-201ENSMUST00000036041 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm45053-201ENSMUST00000206112 2499 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Xkr5-202ENSMUST00000095438 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Bmp2-201ENSMUST00000028836 3555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 E2f3-201ENSMUST00000102948 5097 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Bcl2l2-201ENSMUST00000022806 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Omp-201ENSMUST00000098281 2144 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Trappc9-204ENSMUST00000170633 4688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Togaram2-205ENSMUST00000153445 3302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Plxdc1-201ENSMUST00000017561 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Dstyk-201ENSMUST00000045110 6282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Sf1-208ENSMUST00000131252 4353 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc34Q3UI66 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms