Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 I730028E13Rik-201ENSMUST00000216012 1959 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15429-201ENSMUST00000151268 798 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 1700080E11Rik-202ENSMUST00000190661 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 0610005C13Rik-202ENSMUST00000209510 671 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Golim4-208ENSMUST00000167078 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4858-202ENSMUST00000194595 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Ebf4-201ENSMUST00000110286 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Iffo2-202ENSMUST00000123827 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Haus7-201ENSMUST00000033737 1380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef1-203ENSMUST00000117419 3214 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Adcyap1r1-208ENSMUST00000172084 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37133-201ENSMUST00000192705 1922 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm20488-201ENSMUST00000201641 2996 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Clcnka-202ENSMUST00000105790 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Eno1b-201ENSMUST00000076155 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Lcmt1-201ENSMUST00000033025 1369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Cpne8-201ENSMUST00000014777 697 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Rlbp1-201ENSMUST00000053718 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 F830212C03Rik-201ENSMUST00000191701 2285 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Arr3-201ENSMUST00000113769 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 C130050O18Rik-201ENSMUST00000052176 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Nkx6-3Q3UHX8 Snx12-202ENSMUST00000120389 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms