Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Txn2-203ENSMUST00000109747 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Awat2-201ENSMUST00000033567 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm26728-201ENSMUST00000185268 595 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm43118-201ENSMUST00000199149 775 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 AI463170-204ENSMUST00000220157 447 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Prkcz-201ENSMUST00000030922 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Birc7-201ENSMUST00000108875 1178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm13123-201ENSMUST00000122173 492 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 AC133598.1-201ENSMUST00000224327 660 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Wfdc1-201ENSMUST00000024107 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 N6amt1-203ENSMUST00000118310 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Mlx-202ENSMUST00000107302 1826 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Asb3-206ENSMUST00000203878 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Bach2os-201ENSMUST00000126225 1661 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Slamf8-201ENSMUST00000065679 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 4933427G23Rik-202ENSMUST00000126393 544 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Dnajb6-210ENSMUST00000196528 1018 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gm12500-202ENSMUST00000186471 2428 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Puf60Q3UEB3 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms