Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 AC113031.8-201ENSMUST00000227856 631 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf180Q3U827 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf180Q3U827 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf180Q3U827 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rnf180Q3U827 Gnrhr-202ENSMUST00000094654 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Rnf180Q3U827 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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Rnf180Q3U827 Drg1-201ENSMUST00000020741 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf180Q3U827 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf180Q3U827 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf180Q3U827 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf180Q3U827 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rnf180Q3U827 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf180Q3U827 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf180Q3U827 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf180Q3U827 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf180Q3U827 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Rnf180Q3U827 Uxt-202ENSMUST00000123836 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf180Q3U827 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rnf180Q3U827 Gm43778-201ENSMUST00000199438 199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
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